El recorrido de la natación, con un total de 3.000 metros (en 2006 se ha pasado de 2.500 a 3.000 para ajustarse al nuevo reglamento de la FETRI), se realizará en la presa del embalse de Entrepeñas, al pie de los railes del embarcadero, por los que se sube para acceder a los boxes. Hay que completar dos vueltas a un circuito de 1500 m.

• Salida de Entrepeñas por la N-320 dirección Guadalajara.
• en el km 5 aprox se coge una via de servicio que va para Auñon, por la antigua N-320.
• En Auñon empieza la primera subida de unos 3-4 kms muy llevaderos.
• se pasa por Alhóndiga y se sube la segunda cuesta de 3 kms suavecitos.
• arriba se tuerce en una rotonda por la carretera que va hacia Pastrana.
• se atraviesa Fuentelencina
• se toma el desvio hacia Moratilla de los Meleros
• se atraviesa Moratilla
• se sigue por esa carretera sin coger el desvio que va a Fuentelviejo
• subida de unos 3 kms no excesivamente duros
• se empalma con la carretera que viene de Aranzueque unos 200 metros
• se pasa bajo la N-320 y se va por una via de servicio hasta tomar la carretera que va a Brihuega
• en el desvio de Valfermoso de Tajuña se sigue adelante hasta la siguiente rotonda para volver hasta la rotonda de Valfermoso, y setuerce a la izquierda, para subir hacia La Pinilla dirección Lupiana. Aquí hay otra subida de 4 kms no muy duros.
• Se llega a Lupiana sin llegar a entrar y se sube hacia la N-320. Hay una subida durilla de unos 3 kilometros.
• Se hacia Guadalajara por la vía de servicio de la N-320. Cuidado con las curvas de la bajada.
• Se entra a Guadalajara por la N-320. Bajar con precaución. Se entra a la zona de las pistas por una pequeña vía de servicio de la A-2, que se atraviesa por debajo, por un tunel para dar a las pistas de atletismo.

El sector a pie, que consta de 20 kms., se desarrolla en los alrededores de las pistas de atletismo, donde se realiza la transición, en un circuito al que hay que dar 3 vueltas. Saliendo de las pistas se baja por el parque de San Roque, se rodea el parque de la concordia y se vuelve a subir hacia las pistas por San Roque, torciendo a la izquierda para recorrer la Avenida De Santa Micaela, en un trazado de ida y vuelta. De regreso a la zona de las pistas, se rodean está por la parte de arriba, para ir hacia el Hotel Pax, dando la vuelta a medio camino, para regresar a las pistas, entrando en ellas para completar 3/4 de vuelta por el tartán y volviendo a salir para dar una nueva vuelta al circuito. La cuarta vez que se hace este circuito se encara la recta de meta para finalizar. El recorrido es bastante exigente, sobretodo por la subida del parque de San Roque.